Triển khai mô hình chính quyền hai cấp từ ngày 1/7 đã gặp nhiều khó khăn đối với các phòng kinh tế cấp xã trong xử lý các thủ tục hành chính thuộc lĩnh vực công thương. Sự lúng túng và thiếu chuyên môn trong thực hiện các nhiệm vụ mới đã được thừa nhận bởi nhiều cán bộ cấp xã. Điều này không chỉ dừng lại ở việc thiếu kỹ năng và kinh nghiệm mà còn bao gồm cả sự hạn chế về công cụ và cơ sở vật chất cần thiết cho việc triển khai mô hình mới.

Một số điểm nghẽn cụ thể trong quá trình triển khai mô hình chính quyền hai cấp ở cấp xã bao gồm việc tiếp nhận hồ sơ bị chậm trễ do các nguyên nhân như chậm mở tài khoản ngân sách, thiếu kế toán trưởng hoặc chưa có người phụ trách đúng chuyên ngành. Những khó khăn này không chỉ gây ra sự chậm trễ trong quá trình xử lý các thủ tục hành chính mà còn ảnh hưởng đến hiệu quả hoạt động của các phòng kinh tế cấp xã.
Trước những khó khăn và vướng mắc trong việc triển khai mô hình chính quyền hai cấp, Bộ trưởng Bộ Công Thương Nguyễn Hồng Diên đã nhận định rằng chức năng, nhiệm vụ của phòng kinh tế hạ tầng cấp xã phải thực hiện là rất lớn và không tránh khỏi sự lúng túng và vướng mắc trong giai đoạn đầu. Để hỗ trợ các địa phương, Bộ Công Thương đã thành lập tổ công tác chuyên trách nhằm hỗ trợ và hướng dẫn các địa phương trong việc triển khai mô hình mới.
Bộ Công Thương cũng đã thiết lập đường dây nóng để tiếp nhận các phản hồi và yêu cầu hỗ trợ từ các địa phương. Ngoài ra, bộ cũng đã tổ chức các khóa tập huấn trực tuyến cho cán bộ công thương cấp xã, phường và đặc khu. Bên cạnh đó, Bộ Công Thương đã biên soạn hệ thống tài liệu hướng dẫn và cập nhật lên Cổng thông tin của Bộ và Cổng Dịch vụ công quốc gia nhằm cung cấp thông tin và hướng dẫn cần thiết cho các cán bộ và địa phương.
Tuy nhiên, mặc dù đã có nhiều nỗ lực từ phía Bộ Công Thương và các địa phương, việc tiếp nhận và thực thi nhiệm vụ ở cấp xã vẫn còn những điểm nghẽn. Những khó khăn này không chỉ liên quan đến kỹ thuật và nhân lực mà còn bao gồm cả sự cần thiết phải nâng cao năng lực và trình độ chuyên môn của cán bộ cấp xã.
Trước tình hình này, Bộ Công Thương cho biết sẽ tiếp tục cử lãnh đạo các Cục, Vụ xuống 34 tỉnh, thành phố để phối hợp tháo gỡ khó khăn và yêu cầu các Sở Công Thương địa phương rà soát và đào tạo lại đội ngũ cán bộ công thương cấp xã. Mục tiêu là đảm bảo rằng các cán bộ cấp xã có đủ năng lực và trình độ chuyên môn cần thiết để thực hiện hiệu quả các nhiệm vụ được giao trong khuôn khổ mô hình chính quyền hai cấp.